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No veo razón alguna para que no pueda hipotecar la propiedad.
Es igual que si Usted tiene una casa alquilada y la quiere hipotecar. Son dos situaciones que no son vinculantes.
Es claro, que el banco hará un avalúo de la propiedad. Estando alquilada (produciendo) significa que su valor real es "superior" a que si estuviera ociosa, pero aparte de eso, no debería afectar la viabilidad para hipoteca.